Acte I
Des festivités ecclésiastiques ont lieu en l'honneur de l'ouverture du Concile de Constance. L'orfèvre juif Éléazar continue à travailler, invoquant l'indignation générale des chrétiens du parti. Le gardien de la ville radicale Ruggiero veut que lui et sa fille, Rachel, soient mis à mort, mais le cardinal de Brogni intervient et les sauve. Il leur demande de pardonner aux chrétiens, mais Eléazar refuse étant donné qu'il a souffert à cause d’eux. Dans un second accrochage, le père juif et sa fille sont sauvés de la foule par le prince Léopold, qui prétend être un artiste juif appelé Samuel. Rachel est amoureuse de « Samuel » et ne sait rien de sa véritable identité.
Acte II
Rachel a invité « Samuel » à célébrer Pâque chez elle et chez son père. Lorsqu’il refuse de manger le morceau de pain sans levain qu'elle lui a donné, il éveille les soupçons. Soudain, la princesse Eudoxie, épouse de Léopold, se présente pour acheter une chaîne en or à Éléazar pour la donner en cadeau à son mari. Samuel confesse à Rachel qu'il est chrétien. Elle est désemparée, car une relation entre un chrétien et une juive est passible de la peine de mort. Elle est néanmoins prête à s'enfuir avec lui, mais avant qu'ils puissent partir, ils sont confrontés à Éléazar. Lorsqu’il apprend la vraie religion de l'invité, il veut le tuer, mais Rachel l'arrête. Elle espère une conversion et un mariage, mais pour Léopold c'est impossible et il est expulsé de la maison.
Acte III
Rachel a suivi « Samuel » jusqu'au palais. Elle parvient à entrer et à convaincre Eudoxie de l'engager comme bonne. A l'occasion de la victoire de Léopold sur les hussites hérétiques, Éléazar arrive pour livrer la chaîne de l'or. Quand Eudoxie va la mettre à son mari, Rachel et Léopold le reconnaissent comme leur invité pascal. Rachel accuse le prince d'avoir des relations romantiques avec une juive : elle-même. Le cardinal de Brogni prononce une malédiction sur Léopold, Rachel et Éléazar, à laquelle Eléazar répond par sa propre malédiction envers les chrétiens.
Acte IV
Eudoxie supplie Rachel de retirer ses allégations. Rachel est toujours amoureuse de Léopold et pour le sauver, elle accepte la demande de la princesse. Le cardinal de Brogni accepte de commuer la sentence du prince et promet d'épargner Rachel et Éléazar à condition qu'ils se convertissent au christianisme. En réponse, Éléazar rappelle à Brogni l'époque où ils vivaient tous deux près de Rome, il y a de nombreuses années. Brogni n'était pas encore ecclésiastique, mais comte, et il avait exécuté les fils d'Éléazar comme hérétiques avant de bannir l'orfèvre, le forçant à fuir en Suisse. Peu de temps après, des bandits ont pillé la maison du comte alors qu'il était en ville et y ont mis le feu. Brogni croyait que sa femme et sa petite fille avaient été tuées dans l'incendie, mais Éléazar dit au cardinal que son enfant avait été sauvé par un Juif.
Brogni supplie l'orfèvre de lui dire où est sa fille. Éléazar refuse de révéler la vérité - qu'en se rendant en Suisse, il a trouvé le bébé presque mort, abandonné à l'intérieur de la maison brûlée, et l'a sauvée, la nommant Rachel et l'élevant comme sa propre fille. Éléazar promet d'emporter le secret dans sa tombe pour se venger de Brogni. Réalisant soudain que sa haine des chrétiens pourrait conduire à la mort de Rachel aussi bien qu'à la sienne, Éléazar change momentanément d'avis. Mais quand il entend les cris de la foule chrétienne qui réclame son sang, il décide à nouveau de se venger.
Acte V
Rachel et son père sont condamnés à mort et sont jetés dans un chaudron d'eau bouillante. La foule attend déjà le spectacle avec impatience. Éléazar exhorte une dernière fois Rachel à se sauver en se faisant baptiser, mais, terrifiée, elle accepte cette mort de martyr avec son père. Quand la jeune femme est jetée dans le chaudron, Éléazar révèle son secret à Brogni. Le cardinal tombe à genoux alors que la foule célèbre sa vengeance sur les Juifs.
