I. La chute de Troie
Acte I
Après un siège de dix ans, les Grecs quittent Troie. Les Troyens se réjouissent du départ de leurs ennemis. Ils sortent de la ville et trouvent un cheval de bois, qu’ils considèrent comme une offrande à la déesse Athéna. Cassandre, fille du roi Priam, a de sombres prémonitions; elle prédit la chute sanglante de Troie, mais personne ne lui prête attention, pas même son père ou son fiancé Chorèbe. Priam ordonne que l'une des portes de la ville soit démolie afin que le cheval puisse être transporté à l’intérieur des murs.
Enée raconte que le prêtre Laocoon a vu ce cheval géant comme un complot des Grecs et a exhorté la populace à y mettre le feu, avant d'être dévoré par deux monstrueux serpents. Les Troyens interprètent ce malheur comme une punition de la déesse Athéna. Le cheval géant est porté triomphalement dans Troie.
Acte II - Scène 1
Énée s’est endormie. Le fantôme d'Hector, un héros troyen, lui apparaît et l'avertit du grand incendie qui va ravager Troie. Énée doit sauver les trésors de Troie et emporter les survivants avec lui; en Italie, il fondera un nouvel empire qui plus tard gouvernera le monde entier. Panthée se précipite à l'intérieur, il dit à Enée que les Grecs qui étaient cachés dans le ventre du cheval ont tué les gardes de la ville. Les Grecs qui étaient partis sont revenus et envahissent Troie. Priam est déjà mort. Énée, accompagné de ses fils Ascagne et Chorée, décide de sauver ce qui peut être sauvé.
Acte II - Scène 2
Les femmes de Troie comprennent que Cassandre avait dit vrai, mais qu’il est maintenant trop tard. Pour ne pas être faites prisonnières ou déshonorées, elles décident de mourir avec elle.
II. Les Troyens à Carthage
Acte III
Didon, reine de Carthage, célèbre avec son peuple: il y a sept ans, elle fondait la ville de Carthage après que son frère eut assassiné son mari. Le roi numide Larbas menace d'envahir Carthage si elle n'accepte pas de l'épouser. Didon, cependant, reste fidèle à son mari mort, même si elle ressent les affres de la solitude.
Didon accorde l'asile à un groupe de Troyens en fuite de Troie. Parmi eux, Énée. Il offre son aide à Didon. Énée confie Ascagne aux soins de Didon, puis les Troyens et les Carthaginois partent combattre le roi Larbas.
Acte IV
Didon et Énée se mettent à l'abri d'une tempête. Didon a perdu de vue son gouvernement et n'a d'yeux que pour son sauveur. Il doit lui en dire plus sur les Troyens, en particulier sur Andromaque. Andromaque était veuve, comme Didon, mais après avoir été enlevée, elle avait finalement épousé Pyrrhus, le fils de l'assassin d'Hector et lui-même le meurtrier de son père. Didon voit cela comme un précédent pour la dissolution de son propre vœu de fidélité à son défunt mari Sichée.
Elle hésite, mais sa résistance se brise lorsqu’Ascagne, déguisé en Cupidon, enlève l'anneau de mariage de son doigt. La nuit tombe et Didon et Énée profitent de leur bonheur mutuel. Le dieu Mercure apparaît et rappelle Énée à sa mission: « Italie » retentit trois fois.
Acte V
Les préparatifs s’intensifient : il faut partir immédiatement afin de ne plus offenser les dieux. Les fantômes de Cassandre, Priam, Hector et Chorée apparaissent et disent à Énée de se dépêcher. Malgré les protestations de la reine, Énée quitte Carthage. Seule, Didon décide de se tuer. Elle jette tout ce qui lui rappelle Énée sur un bûcher enflammé. Comme en transe, elle prédit qu’Hannibal vengera sa mort sur les descendants des Troyens. Carthage sera néanmoins finalement détruite. À la grande horreur de tous, elle se poignarde avec l'épée d'Énée. En mourant, elle a une dernière vision de la Rome immortelle. Son peuple jure une haine éternelle pour Énée et son peuple. Une nouvelle guerre se profile.
